江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心紧密围绕国家粮食安全、环境保护和生态文明建设的重大战略所需，结合学校地处环洪泽湖区域的地理优势，面向该区域现代农业发展与湖泊环境保护的地方迫切需求，在“环洪泽湖农业种质资源保护与创新”、“农业优质高效安全生产技术”、“洪泽湖渔业资源保护与健康养殖”、“生物质资源综合利用技术”、“农业资源利用与农业区划”、“湖泊水体污染监控与生态修复”等6个方面开展协同攻关。中心通过体制机制改革等措施，汇聚了长江学者、“国家杰青”、国家“千人计划”、中科院“百人计划”等相关领域权威专家，组建科技创新团队，并在研发平台建设、产学研基地建设、标志性成果打造等方面取得了显著成效。
研究方向
1.环洪泽湖农业种质资源保护与创新研究
对环湖生态区重要的水稻、小麦等作物种质资源，进行从细胞至基因水平的研究、评价；通过分子标记技术等现代生物技术手段，结合常规育种技术，选育出一批适合本生态区的高产、优质、多抗的农作物新品种。
2.农业优质高效安全生产技术研究
结合环湖生态区的生态环境特点，开展农产品的无公害生产新技术研究，集成适应环湖农业生态区的无公害生产新技术体系，研制相关技术操作规程（标准）；开展农业面源污染导致的土壤生态环境问题及其改良方法的研究，促进作物的营养元素利用效率；研究并完善以生物防治为主体的生产体系，提高无公害生产水平。
3.洪泽湖渔业资源保护与健康养殖研究
围绕湖泊生态环境保护与渔业发展的和谐统一，开展洪泽湖水生生物资源调查研究、地方特色水产增养殖技术、水产种苗工程、水产动物营养与病害防治研究；建立无公害水产品养殖规范，对水产品养殖进行全程监控。
4.生物质资源综合利用技术研究
以环湖生态区丰富的水生生物资源、特色植物资源以及生物废弃物料为对象，研究其成分与功能的构效关系及其高效利用技术、精深加工与产业化开发技术等；对农产品及其副产品进行深层次研发，提高生态农业生产的综合效益。
5.农业资源利用与农业区划研究
对环洪泽湖区域进行水、土等农业资源进行全面调查，对水资源利用、土地承载力、土壤质量等进行综合评价，对该区域的主体功能区规划、生态功能区划、农业区划、现代农业、规模农业发展等进行研究，设计开发环洪泽湖农业资源环境信息系统。
6.湖泊水体污染监控与生态修复研究
针对湖泊污染、生态系统退化的现状，开展湖泊水环境监控、富营养化防治和生态修复关键技术等研究；建立适合国情的水环境监测、控制与质量改善技术体系。
